La Via Francigena è protetta come itinerario culturale e paesaggistico di rilevanza europea. La Legge n. 77 del 20 febbraio 2006 "Misure speciali di tutela e fruizione dei siti italiani di interesse culturale, paesaggistico e ambientale, inseriti nella lista del patrimonio mondiale" stabilisce che i beni culturali e paesaggistici, come la Via Francigena, debbano essere tutelati e valorizzati. È obbligatorio evitare qualsiasi forma di alterazione o danno al patrimonio naturale, storico e culturale lungo il percorso.

Ai sensi del Decreto Legislativo n. 81 del 9 aprile 2008, che regola la salute e sicurezza nei luoghi di lavoro e di pubblica fruizione, i pellegrini sono tenuti a seguire norme di sicurezza durante il cammino. Questo include l'obbligo di utilizzare percorsi sicuri segnalati, rispettare la segnaletica presente, e indossare equipaggiamento adeguato, come scarpe adatte, per evitare infortuni. Gli enti locali e le associazioni di pellegrini devono garantire che le infrastrutture e i sentieri siano mantenuti in condizioni sicure per la percorrenza.

Il Decreto Legislativo n. 152 del 3 aprile 2006, noto come "Codice dell'Ambiente", disciplina la gestione e lo smaltimento dei rifiuti in Italia. Questo prevede che lungo la Via Francigena, come in qualsiasi area pubblica, sia vietato l'abbandono di rifiuti. I pellegrini devono portare con sé i propri rifiuti e smaltirli nei contenitori appropriati. Le infrazioni possono essere sanzionate con multe che variano in base alla gravità del danno ambientale.